El informe “Terror y Violencia. Hallazgos sobre fosas clandestinas en México”, realizado por la Universidad Iberoamericana, entre 2011 y 2015 fueron halladas en Puebla 13 fosas clandestinas en tres municipios de la entidad, a estas se le suman 12 más que El Sol de Puebla documentó entre 2017 y lo que va de 2019.
En 2011, en Chignahuapan se encontró una fosa clandestina con dos cuerpos, en Atlixco fue hallada una más con un cuerpo.
En 2015 fueron localizadas 11 fosas en el municipio de Atlixco, aunque el documento consultado no especifica la cantidad de cuerpos que había en ellas.
En noviembre de 2017 una brigada de policías y civiles dio con 2 fosas clandestinas en San Salvador Huixcolotla, con 3 cuerpos putrefactos.
En enero de 2018, una más fue localizada en un terreno baldío también en Huixcolotla. En junio, el cuerpo de una persona fue localizado dentro de una fosa en el municipio de Tecamachalco. Mientras que en noviembre, siete cadáveres fueron ubicados en tres fosas en Palmar de Bravo y Ciudad Serdán.
En 2019, entre el 24 y 25 de enero, fueron encontrados seis cuerpos en un pozo, considerado como fosa, en el paraje El Chupandillo en San José Miahuatlán. Mientras que en abril, una fosa más fue descubierta en Amozoc, con ocho cuerpos, que habrían arrojados el 30 de marzo.
Además en julio en la colonia Del Valle, policías ministeriales ubicaron una fosa clandestina con un cuerpo en avanzado estado de descomposición.
El 21 de julio, en municipio de Huejotzingo, fueron descubiertos tres pozos más, uno con seis cadáveres.
